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RNA Trizol 抽提步驟

發(fā)布時(shí)間： 2021-08-30　　點(diǎn)擊次數(shù)： 2209次

PCR、qRT-PCR 最最初始，都離不開 RNA 的抽提，RNA 質(zhì)量的好壞，直接影響到后續(xù)的反轉(zhuǎn)錄及 PCR 等過程。很多時(shí)候，小伙伴們明明跟著 Trizol 步驟一步一步來的，謹(jǐn)小慎微，不敢懈怠，但就是 RNA 抽提不過關(guān)。其實(shí) Trizol 抽提 RNA 是個(gè)細(xì)活兒，小伙伴們根據(jù)自身的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)，做一下優(yōu)化很有必要~

Trizol 標(biāo)準(zhǔn)抽提步驟（打勾勾的自然是要注意的地方）：
1、將裂解后樣品或勻漿液室溫放置 5-10 min，使得核蛋白與核酸*分離。
?樣品中如含有較多的蛋白質(zhì)、多糖、脂肪或其他細(xì)胞外基質(zhì)，可以 12,000 rpm 離心 10 min，移去漂浮的油脂，取上清。
2、加入 0.2 ml 氯仿，劇烈振蕩 15 sec，室溫放置 3 min。12,000 rpm 4°C 離心 10 min。
?如不能旋渦混勻，可手動(dòng)顛倒混勻 2 min。
?樣品會(huì)分成三層：上層水相，中間層和下層有機(jī)相。RNA 在上層水相中。
3、吸取上層水相轉(zhuǎn)移至干凈的離心管中，加入等體積異丙醇，混勻，室溫放置 20 min。
?不要吸取任何中間層物質(zhì)，否則會(huì)出現(xiàn)染色體 DNA 污染。
4、12,000rpm 4°C 離心 10 min，棄上清。
?離心前 RNA 沉淀通常是不可見的，離心后在管側(cè)和管底形成膠狀沉淀。
5、加入 1 ml 75%乙醇洗滌沉淀。12,000 rpm 4°C 離心 3 min，棄上清。室溫干燥 5-10 min。
?75%乙醇用 DEPC 處理過的水配制。
?通常 1 ml Total RNA Extractor 需用 1 ml 75%乙醇洗滌沉淀。
?不要倒出沉淀，剩余少量液體短暫離心，然后用槍頭吸出，不要吸沉淀。
?不要晾的過干，RNA *干燥后很難溶解，大約晾干 5 min 左右。
6、加入 30-50 µl RNase-free ddH2O，充分溶解 RNA。將所得到的 RNA 溶液置于 -70°C 保存或用于后續(xù)試驗(yàn)。
?對(duì)于肝、胰腺、腎等組織中 RNase 含量很高，沉淀用 100%去離子甲酰胺溶解。

額外的小 TIP~（第三步）：
很多剛開始學(xué)抽提的小伙伴吸取上層水相總是吸到中間層物質(zhì)。既然吸上層手容易抖，那不妨吸下層遺棄然后把剩余的再進(jìn)行離心。這樣多一步，離完心剩下的基本就是上層水相和中間層沉淀，再吸取想要的目標(biāo)就能輕松改掉手抖啦～

Protocal 改善的地方~(還是第三步)：
3、吸取上層水相轉(zhuǎn)移至干凈的離心管中，加入 2.5 倍體積乙醇，1/10 倍體積 3M 醋酸鈉，以及糖原。混勻，-80°C 放置 30-60min。
?不要吸取任何中間層物質(zhì)，否則會(huì)出現(xiàn)染色體 DNA 污染。
?加入糖原，使溶液中糖原的最終濃度達(dá)到 50ng/µl。
?混勻后，-80°C 放置 30 -60min，適當(dāng)增長(zhǎng)孵育時(shí)間或者降低孵育溫度將有助于小 RNA 的沉降。
?以取 500µl 上層水相為例，則需加入 1250µl 乙醇，50µl 醋酸鈉以及 4.5µl 糖原原液（原液濃度為：20mg/ml）。

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