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實時熒光定量PCR的優化（六）
發布時間： 2021-10-14 點擊次數： 1951次引物和探針的濃度也需要尋找*濃度，這通常憑借經驗決定。
為什么要尋找*濃度呢？
因為像Taqman探針在反應過程中會被破壞，需要在起始濃度便保留足量的探針。這個濃度通常是在反應體系中達到250nmol/L。但我們不能無限制的添加探針，這會增加成本，尤其是大批量檢測時，我們需要減少生產試劑的成本。
實際探索優化中，對Taqman探針法為原理的實時熒光定量PCR實驗，我們也可以使用SYBR Green I法對引物濃度進行測試，因為SYBR Green I染料能與任意雙鏈DNA結合，可以檢測到產生的引物二聚體和其他非特異性擴增產物的量。引物二聚體會降低擴增效率和特異性，我們希望找到合適的引物濃度，減少二聚體、非特異性產物的產生。
綜上，我們需要尋找引物和探針的*濃度，保證反應的靈敏度的同時，降低成本，并獲得最大特異性。
在實踐中，我們通常推薦這樣的方法來進行優化：
1、優化引物濃度時從一個標準的濃度開始優化，每次調整濃度后制作標準曲線圖，通過分析標準曲線圖判斷優化效果。推薦的標準優化濃度：Taqman探針法終濃度是500nmol/L，SYBR Green I法是200～400nmol/L。
2、引物濃度效果評判的標準：標準曲線是線性的，且效率>80%，可以認為濃度是合適的，就不需要進一步優化了。
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